李瑶(复旦大学教授)

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李瑶(复旦大学教授)的个人简介

复旦大学生命科学学院遗传学研究所教授。

工作经历

1999.3-至今 复旦大学遗传所从事分子生物学及基因芯片技术的研究工作。

1997.8-1999.1 美国纽约州立大学布法罗分校生物系作博士后,从事酵母病毒RNA与外壳蛋白的相互作用的研究。

1993.8-1997.6复旦大学遗传所从事植物分子遗传学及植物基因工程的研究工作,其间到香港科技大学生物系藻类分子生物学实验室作博士后,从事藻类分子生物学和基因工程的研究。

1989.8-1990.8 四川四达生物工程公司从事生化制药的产品开发工作。

研究方向

1 基因芯片技术的方法学研究和应用研究;

2.肿瘤基因组研究;

3.功能基因组研究。

目前负责的科研项目有:

1. 863计划专项, 利用基因芯片数据构造前列腺癌基因调控网络。2006AA02Z324, 为项目负责人。

获奖情况

1、 获1994年度复旦大学校三八红旗手称号。

2、 “基因芯片技术及产品的应用研究与开发”这个项目获得了2001年度上海市科技进步一等奖,为第三完成人(技术主持人)。

3、 研发的“Biodoor chip4000基因芯片(微矩阵)”荣获2000年度上海市优秀新产品一等奖,为主要完成者(技术主持人)。

4、 2002年被评为杨浦区第5批专业技术拔尖人才。

5、 2003年获上海市总工会颁发的“上海市第五届上海市十大工人发明家”称号。

6、 被上海市科委聘为2003-2004年度的“上海市科委技术预见专家”。

7、 2004年获全国总工会颁发的“全国职工创新能手荣誉称号”。

8、 2005年获得国务院政府特殊津贴。

9、 “人脑胶质瘤分子病理分类、基因表达谱及关键型基因功能研究”项目获2005年上海市科技进步二等奖,为第六完成人。

代表作品

迄今已发表论文80余篇,其中发表35篇SCI论文,影响因子共计约70分。

代表文章(前三作者和通讯作者):

1. Wei Q, Li M, Fu X, Tang R, Na Y, Jiang M, Li Y.Global analysis of differentially expressed genes in androgen-independent prostate cancer. Prostate Cancer Prostatic Dis. 2007 Jan 2; [Epub ahead of print] (通讯作者)

2. Han S, Zhang HT, Wang Z, Xie Y, Tang R, Mao Y, Li Y, DNA repair gene XRCC3 polymorphisms and cancer risk: a meta-analysis of 48 case-control studies. Eur J Hum Genet. 2006; 14(10):1136-44. (通讯作者)

3. Xu J, Miao H, Wu H, Huang W, Tang R, Qiu M, Wen J, Zhu S, Li Y.Screening genetically modified organisms using multiplex-PCR coupled with oligonucleotide microarray. Biosens Bioelectron. 2006,22(1):71-7. (通讯作者)

4. Wei Q, Liu S, Huang J, Mao X, Chu X, Wang Y, Qiu M, Mao Y, Xie Y, Li Y.Comparison of hybridization behavior between double and single strand of targets and the application of asymmetric PCR targets in cDNA microarray. Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2004,37(4) 439~444(通讯作者)

5. Gao X, Fu X, Li T, Zi J, Luo Y, Wei Q, Zeng E, Xie Y, Li Y, Mao Y. Yumin Mao .Determining a Detectable Threshold of Signal Intensity in cDNA Microarray Based on Accumulated Distribution. Journal of Biochemistry and Molecular Biology2003,36(6),554-560, , (通讯作者)

6. Li T, Li Y, Han ZY et al., Optimization of T7-based RNA Amplification System for cDNA Microarray,ACTA BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA SINICA, 2003,35(5),441-448。(通讯作者)

7. Han SZ, Zhang SH, Li R, Zhang WY, Li Y, The common -318C/T polymorphism in the promoter region of CTLA4 gene is associated with reduced risk of ophthalmopathy in Chinese Graves’ patients. Int J Immunogenet. 2006 Aug;33(4):281-7. (通讯作者)

8. Li Y, Li Y, Tang R, Xu H, Qiu M, Chen Q, Chen J, Fu Z, Ying K, Xie Y, Mao Y. Discovery and analysis of hepatocellular carcinoma genes using cDNA microarrays.J Cancer Res Clin Oncol.128(7):369-79. Epub 2002. (第一作者及通讯作者)

9. Li Y, Li T, Liu S, Qiu M, Han Z, Jiang Z, Li R, Ying K, Xie Y, Mao Y. Systematic comparing the fidelity of aRNA, mRNA and T-RNA on gene expression profiling using cDNA microarray. Journal of Biotechnology. 107(2004),19-28

10. Wei Q, Li Y, Chen L, Zhang L, He X, Fu X, Ying K, Huang J, Chen Q, Xie Y, Mao Y. Genes differentially expressed in responsive and refractory acute leukemia.Front Biosci. 2006 , 11:977-82. (并列第一作者)

11. Liu S, Li Y, Fu X, Qiu M, Jiang B, Wu H, Li R, Mao Y, Xie Y. Analysis of the factors affecting the accuracy of detection for single base alterations by oligonucleotide microarray. Exp Mol Med. 2005;37(2):71-7(并列第一作者)

12. Xie JP, Li Y, Yue J, Wang HH et al., Exploring Mycobacterium tuberculosis infection-induced alterations in gene expression in macrophage by microarray hybridization. Science in China(Series C)2003,46(4) 337-347(并列第一作者)

13. Dai J, Li Y, Ji C, Jin F, Zheng Z, Wang X, Sun X, Xu X, Gu S, Xie Y, Mao Y. Characterization of two novel KRAB-domain-containing zinc finger genes, ZNF460 and ZNF461, on human chromosome 19q13.1--q13.4. Cytogenet Genome Res. 2003;103(1-2):74-8.(2.076)(并列第一作者)

14. Zheng H, Li Y, Ji C, Li J, Zhang J, Yin G, Xu J, Ye X, Wu M, Zou X, Gu S, Xie Y, Mao Y. Characterization of a cDNA encoding a protein with limited similarity to beta1, 3-N-acetylglucosaminyltransferase. Mol Biol Rep. 2004 Sep;31(3):171-5. c (并列第一作者)

15. Wang Y, Li Y, Liu S, Shen W, Jiang B, Xu X, Xie Y. Study on the dynamic behavior of a DNA microarray. J Nanosci Nanotechnol. 2005 Aug;5(8):1249-55.(并列第一作者)

16. Han S, Li Y, Mao Y, Xie Y. Meta-analysis of the association of CTLA-4exon-1 +49A/G polymorphism with rheumatoid arthritis.Hum Genet. 2005 118(1):123-32

17. Qi ZY, Li Y, Ying K, Wu CQ, Tang R, Zhou ZX, Chen ZP, Hui GZ, Xie Y. Isolation of novel differentially expressed genes related to human glioma using cDNA microarray and characterizations of two novel full-length genes. J Neurooncol. 2002 Feb;56(3):197-208.

18. Wu M, Li Y, Ji C, Xu J, Zheng H, Zou X, Gu S, Lou Y, Xie Y, Mao Y. Cloning and identification of a novel human gene PDLIM5, a homolog of AD-associated neuronal thread protein (AD7c-NTP). DNA Seq. 2004 Apr;15(2):144-7.

19. Wu Q, Li Y, Gu S, Li N, Zheng D, Li D, Zheng Z, Ji C, Xie Y, Mao Y. Molecular cloning and characterization of a novel dual-specificity phosphatase 23 gene from human fetal J Biochem Cell Biol. 2004 Aug;36(8):1542-53.

20. Zhao E, Li Y, Fu X, Zhang JY, Zeng H, Zeng L, Lin Y, Chen J, Yin G, Qian J, Ying K, Xie Y, Zhao RC, Mao YM. Cloning and expression of human GTDC1 gene (glycosyltransferase-like domain containing 1) from human fetal library.DNA Cell Biol. 2004 Mar;23(3):183-7.

21. Jiang B, Li Y, Wu H, He X, Li C, Li L, Tang R, Xie Y, Mao Y. Application of HLA-DRB1 genotyping by oligonucleotide micro-array technology in forensic medicine. Forensic Sci Int. 2006, 162(1-3):66-73.

22. Zhao E, Li Y, Fu X, Zeng L, Zeng H, Jin W, Chen J, Yin G, Qian J, Ying K, Xie Y, Zhao RC, Mao Y. Cloning and characterization of human synaptotagmin 10 gene. DNA Seq. 2003 Oct;14(5):393-8.

23. Zeng L, Gu S, Li Y, Zhao E, Xu J, Ye X, Wu Q, Wang L, Xie Y, Mao Y. Identification of a novel human doublecortin-domain-containing gene (DCDC1) expressed mainly in testis. J Hum Genet. 2003;48(7):393-6. Epub 2003 Jun 18.

24. Xu Y, Xie J, Li Y, Yue J, Chen J, Chunyu L, Wang H. Using a cDNA microarray to study cellular gene expression altered by Mycobacterium tuberculosis. Chin Med J (Engl). 2003 Jul;116(7):1070-3 Huang Y, Han S, Li Y, Mao Y, Xie Y. Different roles of MTHFR C677T and A1298C polymorphisms in colorectal adenoma and colorectal cancer: a meta-analysis. J Hum Genet. 2006 Nov 7

25. Zeng L, Gu S, Li Y, Wang W, Huang Y, Ye X, Xu J, Zhao E, Ji C, Ying K, Xie Y, Mao Y. cDNA cloning and expression analysis of a novel human F-box domain containing gene. Mol Biol Rep. 2004 Mar;31(1):51-7. (0.851)

26. Fu X, Teng L, Li Y, Chen W, Mao Y, Shen IF, Xie Y. Finding dominant sets in microarray data. Front Biosci. 2005 Sep 1;10:3068-77.

出版著作

1. 高新技术科普丛书《基因芯片技术――解码生命》,化学工业出版社,2004年5月,主编。

2. 《基因芯片与功能基因组研究》,化学工业出版社,2004年9月,主编。

3. 《基因芯片数据分析与处理》化学工业出版社,2006年7月出版,主编

4. 《Cell Biology》, 复旦大学出版社,2006年4月,编委

5. 《现代实用细胞与分子生物学实验技术》,人民军医出版社,2003.1, 编委。

6. “十五”国家重点图书,现代生物技术丛书,《基因工程》,化学工业出版社,2002年7月,负责第十三章《基因芯片技术及其应用》的编写。

专业成果

1、 与司法部上海司法鉴定所合作,2004年通过了科技部“十五攻关”项目“SNP个体识别芯片”(2001BA801D03)成果鉴定。

2、 科技部科技重大专项,中国人肝蛋白质相互作用连锁图的研究.项目编号:2004BA711A19.2004.1.-2005.12.

3、 “十五”863计划生物和农业技术领域生物芯片重大专项课题《基因、蛋白和组织芯片的研究与开发》(上海生物芯片工程研究中心赵国屏教授主持,批准编号:2002AA2Z2002)的子课题《人高覆盖率cDNA芯片技术及其在肿瘤研究中的应用》.

4、 国家自然科学基金项目:同时应用cDNA表达谱和Array-CGH技术研究前列腺癌雄激素敏感和耐受的转变机制。课题编号:30371422。为项目负责人。

5、 上海科技攻关项目:主要转基因农产品的检测技术研究。课题编号 03dz19305。为项目负责人。正在进行。

6、 国家自然科学基金项目:广西鼻咽癌放射敏感性分子生物学研究。课题编号:30260116。合作方负责人。

7、 上海市科委西部开发项目“广西壮汉族鼻咽癌遗传易感性研究”,课题编号:034958041, 2003-1-1至2005-12-31

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